Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vil1Q62468 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vil1Q62468 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vil1Q62468 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vil1Q62468 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vil1Q62468 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Vil1Q62468 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms