Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms