Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CcncQ62447 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CcncQ62447 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CcncQ62447 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CcncQ62447 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CcncQ62447 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CcncQ62447 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CcncQ62447 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CcncQ62447 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CcncQ62447 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CcncQ62447 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CcncQ62447 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms