Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sp4Q62445 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sp4Q62445 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms