Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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Hoxa13Q62424 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
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Hoxa13Q62424 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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Hoxa13Q62424 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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Hoxa13Q62424 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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Hoxa13Q62424 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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Hoxa13Q62424 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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Hoxa13Q62424 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa13Q62424 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
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Hoxa13Q62424 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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Hoxa13Q62424 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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Hoxa13Q62424 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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Hoxa13Q62424 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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