Protein–RNA interactions for Protein: Q62407

Speg, Striated muscle-specific serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 3,262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpegQ62407 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SpegQ62407 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpegQ62407 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpegQ62407 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpegQ62407 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpegQ62407 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpegQ62407 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpegQ62407 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpegQ62407 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpegQ62407 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpegQ62407 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpegQ62407 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SpegQ62407 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SpegQ62407 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpegQ62407 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SpegQ62407 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SpegQ62407 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpegQ62407 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpegQ62407 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SpegQ62407 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpegQ62407 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SpegQ62407 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms