Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sycp1Q62209 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms