Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3bQ62177 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema3bQ62177 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms