Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sin3bQ62141 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms