Protein–RNA interactions for Protein: Q62059

Vcan, Versican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcanQ62059 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcanQ62059 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcanQ62059 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcanQ62059 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcanQ62059 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcanQ62059 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VcanQ62059 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms