Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Npm1Q61937 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Npm1Q61937 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Npm1Q61937 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms