Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms