Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd47Q61735 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms