Protein–RNA interactions for Protein: Q61670

Hlx, H2.0-like homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HlxQ61670 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HlxQ61670 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HlxQ61670 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HlxQ61670 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HlxQ61670 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HlxQ61670 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HlxQ61670 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms