Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Hes3Q61657 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Hes3Q61657 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Hes3Q61657 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hes3Q61657 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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