Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tfap2bQ61313 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms