Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Abcd2Q61285 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcd2Q61285 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms