Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usf1Q61069 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usf1Q61069 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usf1Q61069 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usf1Q61069 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Usf1Q61069 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Usf1Q61069 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Usf1Q61069 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usf1Q61069 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usf1Q61069 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usf1Q61069 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf1Q61069 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf1Q61069 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usf1Q61069 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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