Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbbp4Q60972 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbbp4Q60972 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms