Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Laptm4aQ60961 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms