Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Traf3Q60803 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Traf3Q60803 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms