Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cdkn2cQ60772 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms