Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atf3Q60765 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms