Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcf4Q60722 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tcf4Q60722 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tcf4Q60722 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcf4Q60722 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcf4Q60722 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcf4Q60722 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcf4Q60722 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcf4Q60722 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcf4Q60722 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcf4Q60722 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcf4Q60722 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcf4Q60722 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcf4Q60722 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcf4Q60722 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcf4Q60722 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcf4Q60722 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcf4Q60722 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcf4Q60722 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcf4Q60722 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcf4Q60722 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcf4Q60722 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcf4Q60722 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms