Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SkiQ60698 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SkiQ60698 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SkiQ60698 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SkiQ60698 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SkiQ60698 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SkiQ60698 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SkiQ60698 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SkiQ60698 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SkiQ60698 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SkiQ60698 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SkiQ60698 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SkiQ60698 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SkiQ60698 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms