Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Foxd4Q60688 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms