Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClpbQ60649 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms