Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Prdm1Q60636 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prdm1Q60636 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prdm1Q60636 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prdm1Q60636 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prdm1Q60636 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prdm1Q60636 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Prdm1Q60636 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prdm1Q60636 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prdm1Q60636 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prdm1Q60636 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prdm1Q60636 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prdm1Q60636 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prdm1Q60636 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prdm1Q60636 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prdm1Q60636 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prdm1Q60636 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prdm1Q60636 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prdm1Q60636 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prdm1Q60636 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Prdm1Q60636 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Prdm1Q60636 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prdm1Q60636 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prdm1Q60636 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prdm1Q60636 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prdm1Q60636 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prdm1Q60636 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prdm1Q60636 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Prdm1Q60636 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Prdm1Q60636 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms