Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nr2f1Q60632 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr2f1Q60632 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr2f1Q60632 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr2f1Q60632 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr2f1Q60632 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr2f1Q60632 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nr2f1Q60632 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2f1Q60632 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2f1Q60632 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2f1Q60632 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2f1Q60632 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2f1Q60632 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2f1Q60632 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2f1Q60632 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2f1Q60632 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2f1Q60632 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2f1Q60632 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2f1Q60632 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2f1Q60632 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2f1Q60632 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr2f1Q60632 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms