Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tdrd5Q5VCS6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms