Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Scaf1Q5U4C3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Scaf1Q5U4C3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Scaf1Q5U4C3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms