Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cdcp1Q5U462 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdcp1Q5U462 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms