Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Brip1Q5SXJ3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms