Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Myh1Q5SX40 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Myh1Q5SX40 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms