Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tsr1Q5SWD9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms