Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r195Q5SVD6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vmn1r195Q5SVD6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms