Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ankrd40Q5SUE8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms