Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bbs12Q5SUD9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms