Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Fam71bQ5STT6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fam71bQ5STT6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms