Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sft2d1Q5SSN7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms