Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rtp3Q5QGU6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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