Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttf2Q5NC05 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ttf2Q5NC05 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms