Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vps41Q5KU39 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms