Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZJ0

Drosha, Ribonuclease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DroshaQ5HZJ0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DroshaQ5HZJ0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DroshaQ5HZJ0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms