Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sfmbt2Q5DTW2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sfmbt2Q5DTW2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms