Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf354cQ571J5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf354cQ571J5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf354cQ571J5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf354cQ571J5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf354cQ571J5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf354cQ571J5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf354cQ571J5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf354cQ571J5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf354cQ571J5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Znf354cQ571J5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Znf354cQ571J5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Znf354cQ571J5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Znf354cQ571J5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Znf354cQ571J5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Znf354cQ571J5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms