Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
WhammQ571B6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms