Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf608Q56A10 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms