Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Prune2Q52KR3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prune2Q52KR3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms