Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrig2Q52KR2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.7 ms